Sinds 7 februari 2022 zijn er voor de school statuten van kracht, waarin wordt beschreven dat de school werkt met een bestuursmodel dat voorziet in een directeur-bestuurder en een toezichthoudend deel van het bestuur. De functie van directeur-bestuurder is de enige betaalde functie van het bestuur. Het bestuur heeft alle taken aan de directeur-bestuurder toevertrouwd, met uitzondering van het domein identiteit. Het bestuur komt daarmee in een toezichthoudende rol en zo is de wettelijke scheiding tussen bestuur en toezicht geborgd. Het toezichthoudend deel van het bestuur bevraagt de directeur-bestuurder voortdurend op de kwaliteit en de voortgang van het werk op school en de directeur-bestuurder is gehouden het toezichthoudend deel zo zorgvuldig mogelijk te voorzien van alle informatie die nodig is om goed toezicht te kunnen uitoefenen. Het toezichthoudend deel van het bestuur is als zodanig ook werkgever van de directeur-bestuurder en bespreekt het functioneren van de directeur-bestuurder in een vastgelegd ritme.
Het toezichthoudend deel van het bestuur van de Groen van Prinstererschool wordt voor het grootste deel gekozen uit de leden van de schoolvereniging. Het bestuur draagt daartoe steeds twee personen voor, waartussen de leden kunnen kiezen. het bestuur wijst uit haar midden een voorzitter aan. Naast de gekozen leden van het bestuur, zijn er twee bijzondere bestuurdersstoelen aan te wijzen:
- Eén lid van het bestuur wordt afgevaardigd vanuit de kerkenraad van de Gereformeerde Gemeente te Kampen. Deze persoon neemt zonder last en ruggenspraak deel aan het bestuurswerk en heeft geen zwaardere stem dan de overige leden van het bestuur. Het doel van deze functie is een optimale informatieverbinding tussen de kerk (de initiatiefnemer van de schoolvereniging) en de school.
- Eén lid van het bestuur wordt benoemd zonder dat hij of zij enige binding heeft met de school (dat wil zeggen: hij of zij heeft zelf geen kinderen op school). Deze functie is nu nog een vacature. Het bestuur spant zich in om deze vervuld te krijgen.
Het bestuur vergadert in principe 9 keer per jaar, waarvan één vergadering de Algemene Ledenvergadering betreft (meestal in juni). Het bestuur houdt zich bij het uitvoeren van haar werkzaamheden aan de Code Goed bestuur. Verder hanteert het bestuur een managementstatuut en is er een jaarlijkse vergadercyclus.